MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	AGA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011367	ACG	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011367	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011367	TGG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011367	GGC	2	6	275	280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011367	ACCCC	2	10	328	337	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_011367	TGG	2	6	351	356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011367	TCC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011367	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011367	CCG	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011367	GCC	2	6	641	646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011367	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011367	GGCGCC	2	12	788	799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011367	ACC	2	6	846	851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011367	CTT	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542159
16	NC_011367	CTTC	2	8	1121	1128	0 %	50 %	0 %	50 %	209542159
17	NC_011367	GGA	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542159
18	NC_011367	CAGA	2	8	1278	1285	50 %	0 %	25 %	25 %	209542159
19	NC_011367	AGA	2	6	1298	1303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542159
20	NC_011367	AATA	2	8	1359	1366	75 %	25 %	0 %	0 %	209542159
21	NC_011367	GAA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542159
22	NC_011367	AAAG	2	8	1433	1440	75 %	0 %	25 %	0 %	209542159
23	NC_011367	ATC	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011367	CT	3	6	1726	1731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011367	CGGC	2	8	1757	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011367	TGA	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011367	CAC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011367	TCC	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011367	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011367	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011367	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011367	CGGTGC	2	12	2027	2038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011367	TCA	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011367	CTT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011367	CA	3	6	2093	2098	50 %	0 %	0 %	50 %	209542160
36	NC_011367	GC	3	6	2156	2161	0 %	0 %	50 %	50 %	209542160
37	NC_011367	CGG	2	6	2199	2204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542160
38	NC_011367	CG	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	209542160
39	NC_011367	CTG	2	6	2362	2367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
40	NC_011367	GTCCA	2	10	2401	2410	20 %	20 %	20 %	40 %	209542160
41	NC_011367	CAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542160
42	NC_011367	GCC	2	6	2450	2455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542160
43	NC_011367	ATA	3	9	2492	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542160
44	NC_011367	GCT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
45	NC_011367	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
46	NC_011367	TCG	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
47	NC_011367	GAC	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542160
48	NC_011367	GGC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542160
49	NC_011367	TCG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
50	NC_011367	GCCC	2	8	2709	2716	0 %	0 %	25 %	75 %	209542160
51	NC_011367	ACA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011367	TTC	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011367	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011367	GGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011367	GC	3	6	3077	3082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011367	GCAGG	2	10	3183	3192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011367	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011367	CGG	2	6	3258	3263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011367	GC	3	6	3344	3349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011367	CG	3	6	3352	3357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011367	GCC	2	6	3369	3374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011367	TGCG	2	8	3412	3419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011367	C	6	6	3443	3448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_011367	CGG	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011367	GCA	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542161
66	NC_011367	GGCCTG	2	12	3598	3609	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209542161
67	NC_011367	GCC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542161
68	NC_011367	ACG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542161
69	NC_011367	TGC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542161
70	NC_011367	GCC	2	6	3764	3769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542161
71	NC_011367	CGGGG	2	10	3855	3864	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011367	GGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011367	CAT	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542162
74	NC_011367	CCG	3	9	4074	4082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
75	NC_011367	TCG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542162
76	NC_011367	CAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542162
77	NC_011367	CGC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
78	NC_011367	CAG	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542162
79	NC_011367	GCC	2	6	4249	4254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
80	NC_011367	CGG	2	6	4348	4353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542163
81	NC_011367	GCCG	2	8	4391	4398	0 %	0 %	50 %	50 %	209542163
82	NC_011367	GC	4	8	4403	4410	0 %	0 %	50 %	50 %	209542163
83	NC_011367	TTG	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542163
84	NC_011367	GCC	2	6	4503	4508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542163
85	NC_011367	CTT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542163
86	NC_011367	ATA	2	6	4529	4534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542163
87	NC_011367	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542164
88	NC_011367	GGC	2	6	4714	4719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542164
89	NC_011367	GCT	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542164
90	NC_011367	GCC	2	6	4800	4805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542164
91	NC_011367	GAC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011367	AGA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542165
93	NC_011367	ATC	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542165
94	NC_011367	TC	3	6	5199	5204	0 %	50 %	0 %	50 %	209542165
95	NC_011367	TTG	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542165
96	NC_011367	TGGG	2	8	5309	5316	0 %	25 %	75 %	0 %	209542165
97	NC_011367	AAT	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542165
98	NC_011367	CTTG	2	8	5381	5388	0 %	50 %	25 %	25 %	209542165
99	NC_011367	ATTA	2	8	5397	5404	50 %	50 %	0 %	0 %	209542165
100	NC_011367	AACG	2	8	5411	5418	50 %	0 %	25 %	25 %	209542165
101	NC_011367	CAA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542165
102	NC_011367	A	7	7	5521	5527	100 %	0 %	0 %	0 %	209542165
103	NC_011367	CG	3	6	5537	5542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011367	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011367	TGT	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542166
106	NC_011367	TGA	2	6	5654	5659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542166
107	NC_011367	TTC	2	6	5739	5744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542166
108	NC_011367	GC	3	6	5834	5839	0 %	0 %	50 %	50 %	209542166
109	NC_011367	TCA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542166
110	NC_011367	CGT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542166
111	NC_011367	CT	3	6	5881	5886	0 %	50 %	0 %	50 %	209542166
112	NC_011367	GAT	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542166
113	NC_011367	CT	3	6	5952	5957	0 %	50 %	0 %	50 %	209542166
114	NC_011367	GCCG	2	8	5991	5998	0 %	0 %	50 %	50 %	209542166
115	NC_011367	CGCC	2	8	6029	6036	0 %	0 %	25 %	75 %	209542166
116	NC_011367	TCG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542166
117	NC_011367	AAT	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011367	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011367	CAT	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011367	GTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011367	CTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011367	GGC	2	6	6436	6441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011367	CCCG	2	8	6566	6573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_011367	CGT	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011367	AG	3	6	6640	6645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011367	AT	3	6	6671	6676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011367	GCG	2	6	6691	6696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011367	GATCC	2	10	6714	6723	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011367	GC	3	6	6739	6744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011367	AGG	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011367	CGAA	2	8	6860	6867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011367	AT	3	6	6921	6926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011367	TGT	2	6	6970	6975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011367	ATC	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011367	AATTC	2	10	7017	7026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011367	TCT	2	6	7034	7039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011367	GAC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011367	TGA	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011367	AAACC	2	10	7126	7135	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011367	CGA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
141	NC_011367	GGC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
142	NC_011367	GGC	2	6	7294	7299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
143	NC_011367	TCCGG	2	10	7380	7389	0 %	20 %	40 %	40 %	209542167
144	NC_011367	GGC	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
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272	NC_011367	CGT	2	6	14289	14294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542172
273	NC_011367	ATA	2	6	14316	14321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542172
274	NC_011367	AAT	2	6	14368	14373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542172
275	NC_011367	ACC	2	6	14438	14443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542172
276	NC_011367	CAT	2	6	14461	14466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542172
277	NC_011367	TAC	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542172
278	NC_011367	AT	3	6	14508	14513	50 %	50 %	0 %	0 %	209542172
279	NC_011367	AGTC	2	8	14607	14614	25 %	25 %	25 %	25 %	209542172
280	NC_011367	TAT	2	6	14646	14651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011367	GTC	2	6	14678	14683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_011367	TGC	2	6	14779	14784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542173
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292	NC_011367	GCAC	2	8	15157	15164	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
293	NC_011367	TCA	2	6	15169	15174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542173
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342	NC_011367	TCAG	2	8	17231	17238	25 %	25 %	25 %	25 %	209542174
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401	NC_011367	CCG	2	6	20046	20051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542177
402	NC_011367	CCA	2	6	20069	20074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542177
403	NC_011367	CCT	2	6	20087	20092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209542177
404	NC_011367	GCC	2	6	20122	20127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542177
405	NC_011367	GCC	2	6	20143	20148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542177
406	NC_011367	TCCG	2	8	20149	20156	0 %	25 %	25 %	50 %	209542177
407	NC_011367	CCT	2	6	20180	20185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209542177
408	NC_011367	CG	3	6	20196	20201	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
409	NC_011367	CGG	2	6	20206	20211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542177
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432	NC_011367	CG	3	6	20992	20997	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
433	NC_011367	GCC	2	6	21013	21018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542177
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450	NC_011367	GC	3	6	21738	21743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
451	NC_011367	CG	3	6	21776	21781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
452	NC_011367	TG	3	6	21803	21808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_011367	GAGC	2	8	21893	21900	25 %	0 %	50 %	25 %	209542178
454	NC_011367	CGC	2	6	22000	22005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542178
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480	NC_011367	CACCG	2	10	23243	23252	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
481	NC_011367	GAC	2	6	23362	23367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_011367	AAT	2	6	23373	23378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_011367	GAA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_011367	CAG	2	6	23638	23643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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496	NC_011367	CGG	2	6	23829	23834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542181
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498	NC_011367	GCC	2	6	23909	23914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542181
499	NC_011367	AG	3	6	23926	23931	50 %	0 %	50 %	0 %	209542181
500	NC_011367	GC	4	8	23963	23970	0 %	0 %	50 %	50 %	209542181

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